Fan Liu (Mass Spectrometry)

PROTEOMIK UND MASSENSPEKTROMETRIE
Proteine sind funktionelle Eckpfeiler der Zelle und Veränderungen der Proteinexpression, der posttranslationalen Modifikation (PTM), der Struktur und der Interaktionen sind mit jedem physiologischen und pathologischen Prozess verbunden. Ziel der MS-Facility ist es, modernste MS-Technologien für die Charakterisierung von Proteinen unter allen oben genannten Aspekten bereitzustellen.
Wir verfügen über eine Reihe hochmoderner Massenspektrometer, darunter Orbitrap Fusion Lumos ETD, Orbitrap Fusion ETD und Orbitrap Elite (Thermo Fisher Scientific), die mit Ultra-Performance Liquid Chromatography (UPLC)-Systemen gekoppelt sind.
Darüber hinaus verfügen wir über ein eigenständiges Hochleistungsflüssigkeitschromatographiesystem (HPLC) für die Peptidtrennung und sind in fortschrittlichen Probenvorbereitungsverfahren geschult, um unseren Kooperationspartnern und Mitarbeitern zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse zu liefern.

Die MS-Facility bietet eine breite Palette von Dienstleistungen im Zusammenhang mit der Charakterisierung von Proteinen. Dazu gehören unter anderem:

• Proteinidentifizierung aus Gelen oder in Lösung.
• MS-Affinitätsreinigung zur Identifizierung von Proteininteraktionspartnern.
• globale Proteomquantifizierung unter Verwendung etablierter quantitativer Proteomik-Ansätze, einschließlich markierungsfreier, SILAC- und TMT-Strategien.
• Analyse der posttranslationalen Modifikation (PTM) von Proteinen.
• Erstellung von Proteinstruktur- und Interaktionsprofilen durch Vernetzungsmassenspektrometrie.
• Protein- und Peptidtrennung durch Flüssigchromatographie, einschließlich Reversed-Phase Chromatographie, Größenausschlusschromatographie und Ionenaustauschchromatographie.

Erstnutzer: Bitte kontaktieren Sie uns, um Ihr Projekt zu besprechen.

Regelmäßige Nutzer: Bitte füllen Sie das Formular sample submission form aus, um Ihre Proben zu übergeben.

Neben den Routinedienstleistungen ist die MS-Facility auch aktiv an der Entwicklung von Methoden beteiligt, die auf spezifische Kooperationsprojekte zugeschnitten sind. Unsere jüngsten Forschungen konzentrieren sich auf 1) die Etablierung einer proteomweiten Vernetzungs-Massenspektrometrie-Pipeline (in Zusammenarbeit mit Thermo Fisher Scientific) und 2) die Entwicklung neuartiger Datenerfassungsstrategien für labile posttranslationale Proteinmodifikationen, insbesondere die Pyrophosphorylierung (in Zusammenarbeit mit Prof. Dorothea Fiedler) sowie die Cys-, Lys- und His-Phosphorylierung (in Zusammenarbeit mit Prof. Christian Hackenberger). Weitere Einzelheiten entnehmen Sie bitte unseren Veröffentlichungen.